More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4482 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 240 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.82 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.82 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.91 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  40.72 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  40.45 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  40.91 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.44 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  35.19 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  33.49 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  33.94 
 
 		 309 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  32.43 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.24 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  32.71 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  30.91 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  27.5 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.97 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  25.12 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.67 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.58 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  31.31 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.27 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  30.33 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  30.95 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  35.54 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  32.42 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.19 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.88 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.88 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  28.04 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  31.22 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  26.13 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  26.13 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.71 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  26.73 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.46 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.46 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.46 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  26.13 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  26.13 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  26.63 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  25.66 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  26.13 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.85 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  26.63 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  27 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.24 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  34 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.77 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  34.46 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  26.5 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  25.58 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>