More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0792 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  77.21 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  60.69 
 
 		 292 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  59.66 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  58.13 
 
 		 291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  58.21 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  56.16 
 
 		 305 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  57.24 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  52.19 
 
 		 300 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  55.48 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  53.25 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  55.33 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  54.79 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  54.79 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  53.42 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  55.1 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  55.1 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  54.55 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  55.71 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  55.33 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  54.64 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  54.42 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  52.04 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  47.02 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  55.34 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  53.79 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  51.96 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  46.59 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  46.81 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  48.1 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  40.13 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  41.67 
 
 		 292 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  41.67 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  41.7 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  44.98 
 
 		 287 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  44.64 
 
 		 318 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  46.22 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  46.81 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  44.53 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  41.04 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  41.04 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  46.38 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  45.9 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  44.58 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  44.26 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  39.82 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  38.93 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  42.37 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  43.75 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  40.23 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  43.64 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  37.65 
 
 		 499 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  31.9 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  28.24 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.54 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1213  carboxyl transferase  30.48 
 
 		 500 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  32 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  29.27 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  29.66 
 
 		 527 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  31.82 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  32.6 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0650  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  27.45 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  33.71 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0969  acetyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit beta  27.6 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  29.24 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  31.82 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  30.86 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  28.25 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  29.63 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33750  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  29.27 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03190  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  27.78 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000140956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  30.56 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  28.68 
 
 		 534 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.57 
 
 		 510 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  28.02 
 
 		 522 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  30.9 
 
 		 526 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  29.35 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  31.43 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2413  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.34 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000493188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  29.41 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  32.43 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4701  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  27.64 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  32.4 
 
 		 516 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0566  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  28.27 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0936275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  32.02 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  31.46 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>