More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0283 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  60.89 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  52.24 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  48.51 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.17 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  43.63 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  41.95 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  41.35 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  41.75 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  42.65 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  40.2 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  38.81 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  38.92 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  41.18 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  36.53 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  39.71 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 226 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 227 aa  140  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  36.24 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  40 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  41.18 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  39.02 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  38.65 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  38.65 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  38.83 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  37.07 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  36.27 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  37.56 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  35.38 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  37.97 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  35.35 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.49 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  34.6 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.69 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.69 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  34.9 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  46.73 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  46 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.33 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  51 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 		 280 aa  91.3  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 274 aa  91.3  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  44.35 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  31.22 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  34.66 
 
 		 245 aa  87.8  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  31.42 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  27.32 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  27.8 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  32.3 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  40.54 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.56 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.86 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  29.78 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  30.84 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  30.86 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  29.91 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  31.42 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  29.79 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  30.13 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  31.11 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  39.5 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>