213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5877 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  100 
 
 		 425 aa  842    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  47.38 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  41.49 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 816 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  26.16 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  25.69 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.85 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.61 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  25.85 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  25.06 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  25.13 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  26.22 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  27.09 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  27.56 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  38.4 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 216 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.08 
 
 		 184 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  31.06 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  28.01 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  25 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  25 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  29.87 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 178 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  30.08 
 
 		 153 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.4 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.4 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.53 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  36.07 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.23 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  30.22 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  29.25 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.26 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.9 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  36.8 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.07 
 
 		 184 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 191 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 185 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.59 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  32.67 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 192 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.93 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  26.45 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.99 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  32.23 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.99 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.99 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.99 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  30 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>