249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5464 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 176 aa  350  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  97.73 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.05 
 
 		 186 aa  330  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.48 
 
 		 186 aa  327  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.43 
 
 		 206 aa  327  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.29 
 
 		 191 aa  314  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.33 
 
 		 186 aa  297  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.18 
 
 		 190 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 184 aa  293  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.57 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.61 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  76 
 
 		 182 aa  277  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 193 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 187 aa  276  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.21 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.71 
 
 		 184 aa  270  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.43 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 		 184 aa  268  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.57 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.27 
 
 		 175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 		 182 aa  261  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.86 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.88 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 		 189 aa  257  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 186 aa  254  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  65 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 175 aa  251  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.29 
 
 		 182 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.44 
 
 		 189 aa  251  5.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.84 
 
 		 188 aa  246  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.94 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 184 aa  241  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.82 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.34 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 		 187 aa  234  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 182 aa  234  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.94 
 
 		 185 aa  234  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.73 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 		 181 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.41 
 
 		 181 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 183 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.69 
 
 		 194 aa  227  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 184 aa  226  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  62.43 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 181 aa  220  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 176 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 188 aa  217  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.04 
 
 		 182 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 176 aa  213  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 180 aa  210  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 214 aa  210  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  57.14 
 
 		 179 aa  210  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>