246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1221 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1974  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.22 
 
 
180 aa  333  7e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.7 
 
 
180 aa  320  8e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1336  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.14 
 
 
180 aa  319  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0690  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.7 
 
 
180 aa  319  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516291  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1001  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.77 
 
 
180 aa  317  7e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.14 
 
 
180 aa  316  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1062  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.49 
 
 
181 aa  291  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0842173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  80.23 
 
 
181 aa  290  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.45 
 
 
181 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.15 
 
 
175 aa  214  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
176 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
186 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
186 aa  207  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
206 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
183 aa  205  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 
184 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.65 
 
 
176 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
184 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
190 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
187 aa  201  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
186 aa  200  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.75 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.88 
 
 
183 aa  197  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
178 aa  197  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.29 
 
 
172 aa  197  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.29 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  54.24 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
184 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
182 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
184 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.71 
 
 
184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.41 
 
 
189 aa  194  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
182 aa  194  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 
183 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.88 
 
 
177 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
176 aa  193  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 
187 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.29 
 
 
183 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.88 
 
 
191 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
176 aa  192  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 
189 aa  192  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
176 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.65 
 
 
181 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.65 
 
 
181 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.71 
 
 
185 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 
193 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.57 
 
 
178 aa  191  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 
181 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
182 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
181 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
181 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
172 aa  190  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  54.97 
 
 
179 aa  190  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
182 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.14 
 
 
196 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
174 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
182 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
174 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
199 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
174 aa  190  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  50.28 
 
 
180 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 
189 aa  189  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.69 
 
 
188 aa  189  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
176 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.76 
 
 
182 aa  188  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 
180 aa  188  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.05 
 
 
182 aa  188  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
178 aa  187  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.09 
 
 
175 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
189 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.19 
 
 
179 aa  186  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.05 
 
 
176 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>