247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0843 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
178 aa  349  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 
176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 
176 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
181 aa  236  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
176 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
181 aa  228  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
181 aa  228  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.9 
 
 
176 aa  228  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
176 aa  227  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
185 aa  225  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
180 aa  225  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
180 aa  224  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
180 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
180 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
180 aa  217  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  60.45 
 
 
176 aa  216  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
180 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  56.74 
 
 
181 aa  214  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
183 aa  214  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
174 aa  213  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
176 aa  213  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
181 aa  213  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
177 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
182 aa  210  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
184 aa  210  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
177 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
177 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
178 aa  208  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
204 aa  208  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
180 aa  207  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
182 aa  207  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
177 aa  207  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
172 aa  207  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 
178 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
181 aa  207  9e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
174 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.42 
 
 
181 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
183 aa  204  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.31 
 
 
181 aa  203  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
179 aa  203  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  53.41 
 
 
180 aa  203  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  59.66 
 
 
179 aa  203  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
174 aa  203  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
182 aa  202  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1974  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 
180 aa  202  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
174 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
179 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
182 aa  202  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
181 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 
175 aa  201  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1001  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
180 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
174 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
180 aa  201  6e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
185 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
194 aa  201  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
174 aa  200  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 
188 aa  200  8e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 
182 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
182 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1062  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0842173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.8 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1658  20S proteasome A and B subunits  59.09 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  58.24 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>