254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5624 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  79.31 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.09 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.03 
 
 		 179 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 182 aa  230  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  63.43 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 		 181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 183 aa  214  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1546  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 		 183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 186 aa  210  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.06 
 
 		 204 aa  210  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 206 aa  210  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 176 aa  210  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 		 180 aa  210  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.06 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.78 
 
 		 180 aa  207  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0343  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 178 aa  207  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.38 
 
 		 182 aa  207  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 		 188 aa  205  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.06 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.78 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  53.93 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.01 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0070  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4380  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3086  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0495645 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 		 183 aa  201  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 178 aa  200  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 196 aa  200  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3000  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 178 aa  200  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.51 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3091  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.67 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  49.44 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3138  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.3 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.11 
 
 		 180 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>