247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1556 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.39 
 
 
185 aa  298  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 
182 aa  270  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.84 
 
 
180 aa  266  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.57 
 
 
177 aa  261  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.82 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.65 
 
 
176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.06 
 
 
176 aa  240  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
181 aa  234  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 
183 aa  234  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.75 
 
 
177 aa  231  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.21 
 
 
174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.84 
 
 
181 aa  231  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
182 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
180 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
178 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
187 aa  228  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
182 aa  228  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
177 aa  227  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.84 
 
 
188 aa  226  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
179 aa  226  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
188 aa  226  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
178 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
178 aa  224  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  56.91 
 
 
181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 
184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 
180 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 
180 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.89 
 
 
204 aa  222  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
183 aa  222  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
180 aa  222  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.89 
 
 
181 aa  221  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.94 
 
 
176 aa  221  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
180 aa  221  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 
176 aa  221  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  220  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
180 aa  220  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.11 
 
 
194 aa  220  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
193 aa  219  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
177 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
189 aa  218  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.01 
 
 
181 aa  218  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.72 
 
 
176 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
181 aa  218  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 
182 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.56 
 
 
181 aa  217  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.52 
 
 
180 aa  217  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 
172 aa  216  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 
180 aa  216  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.35 
 
 
174 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
185 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
177 aa  216  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
176 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.19 
 
 
178 aa  215  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
181 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.52 
 
 
180 aa  214  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
184 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 
174 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  56.42 
 
 
180 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
176 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.35 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 
184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1336  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0690  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.93 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.18 
 
 
174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  62.64 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
176 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 
184 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
176 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
186 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
182 aa  210  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 
174 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
206 aa  210  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
176 aa  210  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.59 
 
 
183 aa  209  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
175 aa  209  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.18 
 
 
176 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>