246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0603 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
182 aa  235  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
176 aa  235  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
176 aa  233  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
174 aa  224  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.23 
 
 
177 aa  224  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.32 
 
 
181 aa  223  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 
180 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  221  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
180 aa  221  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
180 aa  218  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  60 
 
 
180 aa  217  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
181 aa  217  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  216  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
180 aa  216  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
180 aa  216  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
182 aa  214  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.35 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  57.71 
 
 
176 aa  210  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
181 aa  210  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
181 aa  209  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 
181 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
176 aa  209  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.1 
 
 
193 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
178 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
177 aa  208  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
182 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
182 aa  208  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
174 aa  208  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
176 aa  208  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
179 aa  207  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.78 
 
 
194 aa  207  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
179 aa  207  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
184 aa  207  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
187 aa  207  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 
177 aa  207  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
178 aa  206  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
174 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
179 aa  204  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
188 aa  204  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
181 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
188 aa  202  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
196 aa  202  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 
182 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
174 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.87 
 
 
181 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
183 aa  201  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 
182 aa  201  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
174 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
176 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 
176 aa  201  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
174 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
188 aa  200  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
174 aa  200  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
176 aa  200  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
182 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
181 aa  198  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3389  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
176 aa  197  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>