246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1439 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.52 
 
 
182 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.97 
 
 
182 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.32 
 
 
182 aa  300  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.57 
 
 
182 aa  300  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.22 
 
 
182 aa  298  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1546  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.91 
 
 
183 aa  279  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 
180 aa  230  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
179 aa  224  8e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
180 aa  222  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  60.23 
 
 
179 aa  222  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 
182 aa  222  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
177 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
204 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
181 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
182 aa  209  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.95 
 
 
179 aa  209  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
181 aa  208  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
185 aa  207  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  63.64 
 
 
183 aa  207  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.33 
 
 
178 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
187 aa  206  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.02 
 
 
178 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 
176 aa  204  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
180 aa  204  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
194 aa  203  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
183 aa  203  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  54.86 
 
 
180 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
176 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.98 
 
 
181 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.78 
 
 
178 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
179 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
174 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 
190 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
193 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.58 
 
 
186 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
183 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.4 
 
 
176 aa  201  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
176 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.99 
 
 
187 aa  201  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.8 
 
 
182 aa  201  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
183 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.11 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
176 aa  198  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 
180 aa  198  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
176 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
196 aa  197  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
172 aa  197  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
176 aa  197  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
174 aa  197  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
175 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0456  20S proteasome A and B subunits  53.63 
 
 
185 aa  197  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.26 
 
 
181 aa  197  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
181 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
181 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.2 
 
 
184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.2 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.22 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
176 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 
178 aa  195  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
176 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
180 aa  195  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.86 
 
 
178 aa  195  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
176 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.11 
 
 
180 aa  195  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.05 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.49 
 
 
181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  53.49 
 
 
176 aa  194  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
176 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
176 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>