248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0819 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.41 
 
 
181 aa  350  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.41 
 
 
181 aa  350  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.47 
 
 
180 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 
180 aa  270  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  270  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 
180 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.79 
 
 
180 aa  269  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.32 
 
 
180 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.66 
 
 
180 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 
181 aa  240  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.34 
 
 
176 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
176 aa  237  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
176 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
180 aa  233  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  61.67 
 
 
179 aa  229  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
185 aa  228  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 
174 aa  214  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 
180 aa  214  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
182 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
182 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
176 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
178 aa  208  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
179 aa  208  4e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.31 
 
 
183 aa  207  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
177 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
188 aa  207  8e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
182 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
181 aa  205  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 
177 aa  203  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
182 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.78 
 
 
178 aa  203  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
177 aa  203  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
180 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 
172 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  57.39 
 
 
176 aa  201  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
182 aa  201  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
204 aa  201  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
176 aa  200  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
178 aa  200  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
186 aa  200  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
176 aa  200  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
176 aa  200  9e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.8 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  57.78 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
182 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.89 
 
 
181 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
182 aa  198  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
184 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
175 aa  198  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
176 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.19 
 
 
185 aa  198  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 
182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
190 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
178 aa  197  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  56.65 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0919  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0345586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0456  20S proteasome A and B subunits  57.39 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1546  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
175 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
206 aa  195  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 
184 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
186 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
185 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
177 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.11 
 
 
184 aa  194  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
174 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>