246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2124 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.77 
 
 
185 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.53 
 
 
182 aa  295  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.84 
 
 
181 aa  266  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
176 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.71 
 
 
176 aa  235  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
180 aa  231  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
180 aa  229  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
180 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 
177 aa  228  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
182 aa  226  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  225  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  225  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
180 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 
181 aa  225  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
182 aa  225  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 
181 aa  225  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 
183 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
178 aa  222  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
174 aa  221  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
181 aa  220  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
181 aa  220  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
177 aa  219  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
182 aa  218  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
188 aa  218  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
178 aa  217  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
178 aa  217  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 
184 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  59.2 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.76 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 
180 aa  214  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
184 aa  214  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
182 aa  214  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
176 aa  214  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.33 
 
 
194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 
204 aa  211  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
187 aa  209  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 
183 aa  209  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
182 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
178 aa  209  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
181 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 
181 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
176 aa  209  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
182 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
179 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
193 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  207  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  207  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 
182 aa  207  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
184 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
182 aa  206  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
176 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
174 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
188 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
176 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
214 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 
174 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 
174 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
179 aa  205  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
172 aa  205  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
176 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
182 aa  205  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 
189 aa  204  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
189 aa  204  5e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  204  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
174 aa  203  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  59.2 
 
 
179 aa  203  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
176 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.65 
 
 
174 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
183 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
193 aa  203  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>