246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1030 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0690  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.53 
 
 
180 aa  291  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.23 
 
 
177 aa  290  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.97 
 
 
180 aa  289  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.97 
 
 
181 aa  289  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1336  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.97 
 
 
180 aa  289  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.4 
 
 
180 aa  287  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1001  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.98 
 
 
180 aa  287  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1974  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.27 
 
 
180 aa  277  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1062  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.58 
 
 
181 aa  271  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0842173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
185 aa  210  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
176 aa  207  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.91 
 
 
181 aa  207  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.93 
 
 
175 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 
182 aa  205  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.29 
 
 
183 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.07 
 
 
176 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  201  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
178 aa  201  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
177 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
178 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.33 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 
187 aa  198  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.22 
 
 
182 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.56 
 
 
184 aa  197  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.49 
 
 
181 aa  197  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
186 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 
176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
187 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
182 aa  194  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.37 
 
 
184 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.22 
 
 
181 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 
178 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
184 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
190 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
172 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
186 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
181 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.32 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 
188 aa  192  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.32 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.32 
 
 
174 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
181 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.22 
 
 
182 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
176 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
182 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
176 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  50 
 
 
204 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
188 aa  190  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  53.67 
 
 
179 aa  190  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.07 
 
 
180 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
182 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 
177 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
196 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
174 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
181 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.1 
 
 
181 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
193 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.29 
 
 
182 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
183 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
206 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  49.44 
 
 
189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
180 aa  188  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 
183 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.5 
 
 
183 aa  187  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.48 
 
 
176 aa  187  9e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  50.59 
 
 
180 aa  187  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.59 
 
 
179 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.35 
 
 
182 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.01 
 
 
185 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.28 
 
 
188 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.94 
 
 
174 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.27 
 
 
172 aa  185  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.29 
 
 
176 aa  184  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 
176 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.29 
 
 
176 aa  184  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  53.37 
 
 
176 aa  184  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.07 
 
 
189 aa  184  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.1 
 
 
184 aa  184  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.35 
 
 
176 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>