246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1001 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1001  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.77 
 
 
177 aa  317  7e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  85 
 
 
180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0690  ATP-dependent protease peptidase subunit  85 
 
 
180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1336  ATP-dependent protease peptidase subunit  84.44 
 
 
180 aa  311  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1974  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.67 
 
 
180 aa  310  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.33 
 
 
180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1062  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.87 
 
 
181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0842173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  78.98 
 
 
181 aa  287  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.22 
 
 
181 aa  270  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.32 
 
 
175 aa  205  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
180 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 
176 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 
176 aa  198  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 
183 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
180 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
176 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.93 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.07 
 
 
176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 
186 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
206 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 
181 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
176 aa  193  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
176 aa  193  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.51 
 
 
182 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.84 
 
 
184 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
184 aa  192  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.96 
 
 
182 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.63 
 
 
178 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
187 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.31 
 
 
186 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.78 
 
 
187 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
182 aa  191  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
182 aa  191  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  54.97 
 
 
176 aa  191  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
180 aa  190  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
184 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 
181 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 
190 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
194 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.29 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  54.39 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  51.14 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
178 aa  188  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.74 
 
 
181 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 
184 aa  187  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
185 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
177 aa  187  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.35 
 
 
187 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.49 
 
 
172 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.48 
 
 
176 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.1 
 
 
174 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0302  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
182 aa  186  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 
193 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 
181 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 
182 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.87 
 
 
181 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.76 
 
 
178 aa  184  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
184 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  184  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
184 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.12 
 
 
188 aa  184  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.66 
 
 
176 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.01 
 
 
176 aa  183  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.98 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.35 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.05 
 
 
176 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.48 
 
 
196 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.88 
 
 
174 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 
189 aa  182  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  49.43 
 
 
189 aa  181  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.46 
 
 
177 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.43 
 
 
183 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.44 
 
 
176 aa  181  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>