248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2987 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.78 
 
 
182 aa  271  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.45 
 
 
184 aa  268  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.98 
 
 
190 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.84 
 
 
187 aa  265  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.65 
 
 
184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 
186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 
193 aa  264  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.62 
 
 
186 aa  264  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 
186 aa  263  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.6 
 
 
187 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.83 
 
 
184 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.25 
 
 
184 aa  261  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.25 
 
 
184 aa  260  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
176 aa  257  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.39 
 
 
188 aa  257  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.2 
 
 
193 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 
183 aa  255  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.58 
 
 
187 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.59 
 
 
189 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.29 
 
 
182 aa  251  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.93 
 
 
185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
175 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 
186 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.45 
 
 
185 aa  247  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 
184 aa  245  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.82 
 
 
182 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.28 
 
 
197 aa  245  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.93 
 
 
182 aa  241  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 
185 aa  240  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 
184 aa  239  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 
185 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 
185 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
175 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.75 
 
 
189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 
185 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.21 
 
 
185 aa  230  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.68 
 
 
189 aa  229  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
188 aa  229  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.3 
 
 
188 aa  225  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
178 aa  222  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
204 aa  222  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
181 aa  221  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
177 aa  217  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 
181 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
182 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
187 aa  215  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
182 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
178 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
174 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.44 
 
 
193 aa  210  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
185 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
179 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.64 
 
 
194 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
176 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
176 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
181 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
176 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.87 
 
 
196 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
174 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  58.52 
 
 
179 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 
184 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  55.68 
 
 
180 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
175 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
183 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
177 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
172 aa  205  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
182 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
181 aa  204  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 
174 aa  204  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
176 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.34 
 
 
178 aa  202  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
176 aa  201  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
176 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.95 
 
 
176 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.06 
 
 
188 aa  201  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
180 aa  201  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
188 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.1 
 
 
182 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
174 aa  201  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.58 
 
 
176 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
182 aa  200  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  58.58 
 
 
176 aa  200  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.95 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>