253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2791 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.95 
 
 		 185 aa  331  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.95 
 
 		 185 aa  330  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  88.95 
 
 		 185 aa  328  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.98 
 
 		 185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.87 
 
 		 185 aa  310  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.69 
 
 		 185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.05 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 		 189 aa  245  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.12 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 175 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.84 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.84 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 		 190 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.84 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 186 aa  240  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.03 
 
 		 184 aa  239  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.02 
 
 		 186 aa  237  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.03 
 
 		 184 aa  236  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.03 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.24 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.48 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 175 aa  230  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.45 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.8 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.12 
 
 		 182 aa  227  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.32 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.06 
 
 		 189 aa  220  9e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.13 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 		 204 aa  212  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.07 
 
 		 183 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 182 aa  210  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 184 aa  210  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 173 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.16 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 		 174 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 174 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 172 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 175 aa  197  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.22 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 174 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.23 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 178 aa  193  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  54.75 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.98 
 
 		 180 aa  191  7e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 		 176 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 178 aa  190  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  56.25 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.87 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>