248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2558 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.97 
 
 		 197 aa  294  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.73 
 
 		 186 aa  287  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.94 
 
 		 184 aa  287  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.94 
 
 		 184 aa  285  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.11 
 
 		 190 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.98 
 
 		 176 aa  276  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.46 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.84 
 
 		 176 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.46 
 
 		 186 aa  274  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.46 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.98 
 
 		 182 aa  267  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.24 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.56 
 
 		 193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.27 
 
 		 187 aa  264  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.91 
 
 		 187 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.65 
 
 		 184 aa  263  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.02 
 
 		 184 aa  260  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.56 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.09 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 		 175 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 		 187 aa  252  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.75 
 
 		 193 aa  251  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.3 
 
 		 189 aa  251  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.62 
 
 		 182 aa  245  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.39 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.1 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.03 
 
 		 182 aa  244  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 		 183 aa  244  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.3 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 		 188 aa  241  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 		 175 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.93 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.32 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.84 
 
 		 199 aa  237  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.77 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.23 
 
 		 185 aa  235  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.16 
 
 		 184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.59 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.37 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.17 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.12 
 
 		 189 aa  231  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.67 
 
 		 188 aa  227  9e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 		 182 aa  224  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.24 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.22 
 
 		 183 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 174 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 181 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 193 aa  214  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.33 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 175 aa  214  8e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.78 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 172 aa  212  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.69 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 174 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.79 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.92 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.1 
 
 		 178 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.91 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 174 aa  207  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.78 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  55.62 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 174 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.44 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 174 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>