247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0644 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  98.39 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  95.68 
 
 		 206 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.18 
 
 		 176 aa  329  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.05 
 
 		 176 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.9 
 
 		 191 aa  323  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.02 
 
 		 190 aa  297  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.82 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.38 
 
 		 186 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  80 
 
 		 184 aa  288  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.79 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.71 
 
 		 182 aa  280  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.84 
 
 		 193 aa  277  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.78 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.46 
 
 		 193 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.21 
 
 		 197 aa  274  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.71 
 
 		 184 aa  269  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.71 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 		 184 aa  267  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 189 aa  265  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.57 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.88 
 
 		 187 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.07 
 
 		 183 aa  263  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.1 
 
 		 175 aa  261  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.73 
 
 		 182 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.89 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.86 
 
 		 186 aa  257  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.43 
 
 		 182 aa  255  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  65 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.19 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.79 
 
 		 188 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.26 
 
 		 175 aa  248  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.13 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.4 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.86 
 
 		 184 aa  247  8e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.11 
 
 		 199 aa  247  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.85 
 
 		 185 aa  246  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.46 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.75 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.84 
 
 		 184 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.69 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.75 
 
 		 181 aa  234  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.04 
 
 		 182 aa  234  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.13 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.04 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 181 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 183 aa  230  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 		 178 aa  227  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 181 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 172 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 176 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  58.66 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  59.89 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 		 183 aa  217  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.98 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 176 aa  215  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  62.01 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 		 174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.24 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 176 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 174 aa  210  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 180 aa  210  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>