More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5333 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  82.38 
 
 		 535 aa  845    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 570 aa  1151    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  45.19 
 
 		 523 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  48.86 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  47.77 
 
 		 654 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  47.77 
 
 		 657 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  48.54 
 
 		 616 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  47.43 
 
 		 291 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  46.83 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  44.57 
 
 		 292 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  48.46 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  44.9 
 
 		 698 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  49.8 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  41.54 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  44.44 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.11 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  43.56 
 
 		 301 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  40.95 
 
 		 240 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  42.08 
 
 		 283 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  39.02 
 
 		 282 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  42.08 
 
 		 284 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.36 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  43.35 
 
 		 292 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.12 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 		 617 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  43.7 
 
 		 277 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  40.93 
 
 		 518 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 637 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  38.52 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  42.37 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  37.59 
 
 		 303 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  40.61 
 
 		 286 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  39.53 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.04 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  39.57 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  36.06 
 
 		 802 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  40.08 
 
 		 925 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.45 
 
 		 338 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.55 
 
 		 426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  39.08 
 
 		 781 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 593 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1911 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 		 625 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  39.83 
 
 		 636 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 		 628 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  35.66 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.23 
 
 		 522 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 		 882 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 623 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.36 
 
 		 416 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 		 616 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  38.56 
 
 		 287 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  38.56 
 
 		 820 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  36.58 
 
 		 654 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.55 
 
 		 291 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  39.75 
 
 		 877 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  35 
 
 		 336 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 620 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  37.45 
 
 		 929 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  39.43 
 
 		 246 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 		 621 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  35.05 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  40.17 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.21 
 
 		 292 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  37.97 
 
 		 620 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.6 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 		 291 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  37.96 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.05 
 
 		 892 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.85 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  36.32 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.29 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  37.2 
 
 		 281 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1196 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.92 
 
 		 600 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.43 
 
 		 295 aa  136  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  34.68 
 
 		 267 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  34.16 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  38.31 
 
 		 1132 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  36.16 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 639 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 639 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  37.85 
 
 		 527 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  37.65 
 
 		 664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.59 
 
 		 269 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  38.33 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  34.94 
 
 		 292 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  34.94 
 
 		 292 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  35.32 
 
 		 287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  36.86 
 
 		 862 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.86 
 
 		 288 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  32.36 
 
 		 624 aa  126  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.48 
 
 		 553 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33 
 
 		 952 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  39.57 
 
 		 263 aa  124  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>