More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2761 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  58.56 
 
 
802 aa  899    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
788 aa  1633    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  41.34 
 
 
778 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  41.59 
 
 
778 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  41.19 
 
 
777 aa  624  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  40.39 
 
 
790 aa  608  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  41.88 
 
 
772 aa  602  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.96 
 
 
771 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.53 
 
 
773 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.07 
 
 
760 aa  558  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.86 
 
 
798 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  37.65 
 
 
817 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.47 
 
 
805 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.26 
 
 
785 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.04 
 
 
771 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.15 
 
 
782 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.88 
 
 
778 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.23 
 
 
755 aa  519  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.66 
 
 
791 aa  522  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.69 
 
 
803 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.96 
 
 
769 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.73 
 
 
809 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.4 
 
 
790 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.3 
 
 
807 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 
806 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.23 
 
 
760 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.1 
 
 
768 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.66 
 
 
795 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.91 
 
 
783 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.18 
 
 
760 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.29 
 
 
813 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.15 
 
 
792 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.5 
 
 
811 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.91 
 
 
784 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.99 
 
 
756 aa  475  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.8 
 
 
807 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 
1037 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.67 
 
 
808 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.67 
 
 
757 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 
902 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  33.05 
 
 
811 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.2 
 
 
760 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.16 
 
 
754 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  32.37 
 
 
789 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.69 
 
 
737 aa  392  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.65 
 
 
738 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.44 
 
 
721 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.17 
 
 
801 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 
743 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 
766 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
799 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.39 
 
 
804 aa  386  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  32.41 
 
 
727 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 
750 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  32.41 
 
 
727 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.04 
 
 
740 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.61 
 
 
751 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.99 
 
 
859 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.77 
 
 
765 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.68 
 
 
743 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.92 
 
 
774 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  31.46 
 
 
766 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 
768 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.48 
 
 
745 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.42 
 
 
752 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 
765 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.94 
 
 
768 aa  364  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 
768 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 
769 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.25 
 
 
787 aa  363  9e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
702 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  31.92 
 
 
793 aa  362  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 
764 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  30.11 
 
 
755 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  30.11 
 
 
765 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  29.53 
 
 
765 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  30.68 
 
 
764 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.53 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  29.53 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.99 
 
 
755 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  29.53 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 
769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  29.53 
 
 
765 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.53 
 
 
765 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  29.99 
 
 
755 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  29.53 
 
 
765 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.73 
 
 
755 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  29.53 
 
 
765 aa  357  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  29.66 
 
 
772 aa  357  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 
759 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  30.96 
 
 
764 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  29.4 
 
 
765 aa  354  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 
772 aa  350  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
753 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  31.08 
 
 
743 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 
751 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  31.22 
 
 
765 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  31.76 
 
 
759 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.84 
 
 
733 aa  343  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>