More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0387 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  94.82 
 
 
367 aa  697    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  731    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  94.28 
 
 
367 aa  691    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1616  ABC transporter related  58.54 
 
 
344 aa  401  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1422  ABC transporter related  49.48 
 
 
373 aa  315  5e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.157583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  45.53 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 
351 aa  222  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  42.38 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  39.81 
 
 
355 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  34.36 
 
 
345 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
393 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
395 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  46.54 
 
 
379 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
384 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  41.91 
 
 
367 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.84 
 
 
348 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 
384 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
377 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  39.11 
 
 
355 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.57 
 
 
367 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  38.55 
 
 
381 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.59 
 
 
382 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  32.92 
 
 
359 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 
349 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  39.84 
 
 
384 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
366 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 
369 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.36 
 
 
358 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 
387 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  30.11 
 
 
363 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  41.35 
 
 
319 aa  192  6e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.37 
 
 
342 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 
378 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
367 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  35.28 
 
 
361 aa  192  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 
355 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1518  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 
362 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0467578  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
384 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3812  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
364 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  39.08 
 
 
368 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  45.69 
 
 
312 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3296  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
364 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4045  ABC transporter related  39.22 
 
 
367 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
382 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  39.2 
 
 
386 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  46.12 
 
 
312 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  47.41 
 
 
314 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.5 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  40.83 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4665  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.879572  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 
367 aa  190  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  32.19 
 
 
366 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.19 
 
 
349 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  40.83 
 
 
382 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  31.52 
 
 
363 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  42.86 
 
 
382 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 
380 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.15 
 
 
380 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4448  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
370 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3609  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
370 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00717179  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.77 
 
 
369 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3918  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
370 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.7 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
372 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.73 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  33.45 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.58 
 
 
360 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.4 
 
 
356 aa  189  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  39.55 
 
 
372 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
343 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.37 
 
 
382 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1734  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 
363 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4696  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.79 
 
 
364 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.74 
 
 
368 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  37.04 
 
 
527 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 
369 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  31.56 
 
 
366 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
370 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1467  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.78 
 
 
362 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765075  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
383 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.52 
 
 
358 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  40.34 
 
 
350 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  41.47 
 
 
357 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
355 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4321  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.06 
 
 
363 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.412011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.05 
 
 
363 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.44 
 
 
374 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
327 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.8 
 
 
354 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
374 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.94 
 
 
327 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33 
 
 
365 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  34.14 
 
 
367 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
327 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>