More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0063 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
304 aa  597  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  59.15 
 
 
324 aa  320  2e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  60.48 
 
 
298 aa  320  2e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  59.25 
 
 
304 aa  315  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.63 
 
 
303 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.81 
 
 
315 aa  314  1e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.29 
 
 
303 aa  314  1e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  55.48 
 
 
299 aa  313  2e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.88 
 
 
299 aa  313  2e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.01 
 
 
300 aa  313  2e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.01 
 
 
299 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.56 
 
 
299 aa  307  1e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.3 
 
 
299 aa  301  7e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.02 
 
 
299 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.17 
 
 
298 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.7 
 
 
300 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.61 
 
 
299 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.17 
 
 
298 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.9 
 
 
300 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.9 
 
 
300 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.36 
 
 
300 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.77 
 
 
299 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  51.17 
 
 
298 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.01 
 
 
296 aa  295  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.84 
 
 
298 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.36 
 
 
300 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  51.51 
 
 
310 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  51.88 
 
 
291 aa  291  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.5 
 
 
313 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.68 
 
 
294 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.46 
 
 
328 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.08 
 
 
302 aa  286  3e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.15 
 
 
311 aa  285  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.01 
 
 
300 aa  285  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  55.36 
 
 
294 aa  284  1e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.35 
 
 
311 aa  283  3e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  51.37 
 
 
306 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.94 
 
 
302 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.57 
 
 
305 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  45.64 
 
 
299 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.99 
 
 
303 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.99 
 
 
303 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.99 
 
 
303 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.6 
 
 
277 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.08 
 
 
303 aa  273  2e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.99 
 
 
303 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  56.55 
 
 
295 aa  270  3e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3374  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.46 
 
 
328 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  50.85 
 
 
296 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  54.04 
 
 
304 aa  268  9e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  52.68 
 
 
304 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  51.39 
 
 
318 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  48.54 
 
 
321 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  51.96 
 
 
312 aa  265  6e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  49 
 
 
297 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  48.3 
 
 
299 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.85 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  46.62 
 
 
299 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.66 
 
 
311 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.29 
 
 
329 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  51.89 
 
 
298 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.52 
 
 
306 aa  259  5e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.52 
 
 
306 aa  259  5e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.87 
 
 
306 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.87 
 
 
306 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.69 
 
 
339 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  51.97 
 
 
335 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.87 
 
 
306 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.19 
 
 
307 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.67 
 
 
291 aa  256  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  45.95 
 
 
301 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.21 
 
 
306 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.51 
 
 
307 aa  253  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  2e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.39 
 
 
310 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  46.53 
 
 
332 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  47.8 
 
 
295 aa  253  4e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0117  tyrosine recombinase XerC  53.42 
 
 
316 aa  252  5e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  46.76 
 
 
299 aa  251  8e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.7 
 
 
306 aa  251  8e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  46.76 
 
 
299 aa  251  8e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  46.76 
 
 
299 aa  251  9e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  51.97 
 
 
342 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  42.23 
 
 
307 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
306 aa  246  5e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  46.51 
 
 
302 aa  246  5e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  46.96 
 
 
293 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  48.51 
 
 
311 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 
307 aa  244  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  47.1 
 
 
306 aa  244  1e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>