More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2213 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  100 
 
 
398 aa  821    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  69.6 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  66.08 
 
 
398 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  65.35 
 
 
384 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  65 
 
 
384 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  61.76 
 
 
394 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  61.83 
 
 
398 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  61.83 
 
 
398 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  60.81 
 
 
398 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  61.44 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  62.92 
 
 
399 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  62.21 
 
 
396 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  60.41 
 
 
398 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  62.66 
 
 
393 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  61.62 
 
 
394 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  62.04 
 
 
404 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  59.85 
 
 
392 aa  484  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  62.72 
 
 
390 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  56.2 
 
 
400 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  56.43 
 
 
392 aa  461  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  57.96 
 
 
414 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  56.48 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  54.71 
 
 
394 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  58.55 
 
 
392 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  58.38 
 
 
382 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  54.19 
 
 
388 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.44 
 
 
409 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  55.91 
 
 
382 aa  429  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  54.2 
 
 
395 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  54.83 
 
 
396 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  54.33 
 
 
403 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  53.81 
 
 
383 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.63 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  53.02 
 
 
383 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.43 
 
 
417 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 
404 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  52.23 
 
 
388 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.51 
 
 
407 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  48.73 
 
 
396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.07 
 
 
391 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  52.52 
 
 
380 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.47 
 
 
379 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
384 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  50.78 
 
 
403 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  51.04 
 
 
405 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  47.3 
 
 
389 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  50.4 
 
 
381 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 
430 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  50.26 
 
 
405 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  52.58 
 
 
408 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  49.49 
 
 
400 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  45.78 
 
 
391 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  47.92 
 
 
388 aa  371  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.04 
 
 
400 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  50.4 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  49.36 
 
 
406 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  46.48 
 
 
393 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  47.04 
 
 
391 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
401 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  48.35 
 
 
406 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.19 
 
 
402 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
401 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  48.35 
 
 
394 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  48.09 
 
 
406 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.74 
 
 
398 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  47.22 
 
 
404 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  48.96 
 
 
404 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  47.63 
 
 
400 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  48.05 
 
 
400 aa  365  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
407 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.74 
 
 
403 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  49.35 
 
 
396 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.31 
 
 
403 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
407 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.85 
 
 
436 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  49.07 
 
 
381 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.85 
 
 
436 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
404 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  48.05 
 
 
410 aa  363  4e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
401 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.53 
 
 
389 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  362  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  48.6 
 
 
406 aa  362  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  49.07 
 
 
381 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.59 
 
 
403 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>