More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2655 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  89.78 
 
 
225 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  79.91 
 
 
226 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  79.91 
 
 
226 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  79.91 
 
 
226 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  73.01 
 
 
223 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  64.68 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  65.6 
 
 
220 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  53.49 
 
 
203 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  46.51 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 
225 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 
204 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
198 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.17 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  37.27 
 
 
226 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.78 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 
208 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
218 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 
249 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
232 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.1 
 
 
213 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
212 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
232 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.74 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.25 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.4 
 
 
382 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  27.08 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 
195 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
207 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
208 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 
370 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.8 
 
 
227 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.62 
 
 
378 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
412 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.25 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  30.3 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  33.73 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  34.71 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  37.21 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  37.06 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 
205 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  39.33 
 
 
199 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>