103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1612 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  83.62 
 
 		 574 aa  963    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1149    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  54.58 
 
 		 1046 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10791  hypothetical protein  59.5 
 
 		 259 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4567  hypothetical protein  53.82 
 
 		 242 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4655  hypothetical protein  53.82 
 
 		 242 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4950  hypothetical protein  53.82 
 
 		 242 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.33122  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  33.23 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0312  hypothetical protein  31.82 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0370302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  31.33 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1712  hypothetical protein  31.71 
 
 		 243 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0676691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  29.64 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  32.42 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  33.06 
 
 		 356 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2995  hypothetical protein  30.31 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.140186  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  36.92 
 
 		 362 aa  102  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2130  hypothetical protein  33.21 
 
 		 263 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000306973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  30.18 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  29.82 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  28.96 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  30.14 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  26.87 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  29.7 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.72 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  31.43 
 
 		 198 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0250  hypothetical protein  30.63 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  25.83 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1303  hypothetical protein  26.95 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  33.85 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2118  hypothetical protein  31.58 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  29.7 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  29.7 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  26.95 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  32.34 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  27.4 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  32.14 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  30.77 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  27.16 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  31.14 
 
 		 217 aa  57  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.74 
 
 		 224 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  25.58 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  27.65 
 
 		 208 aa  55.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  25.42 
 
 		 246 aa  55.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  34.88 
 
 		 247 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  30.21 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  32.54 
 
 		 223 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.99 
 
 		 216 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  29.11 
 
 		 268 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.36 
 
 		 570 aa  53.9  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  29.11 
 
 		 268 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.99 
 
 		 216 aa  53.5  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  29.66 
 
 		 342 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  30.77 
 
 		 230 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  29.7 
 
 		 256 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2284  hypothetical protein  24.3 
 
 		 250 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  27.44 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  27.44 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  27.22 
 
 		 212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2838  hypothetical protein  25.3 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  28.48 
 
 		 211 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0011  hypothetical protein  26.74 
 
 		 274 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  28.14 
 
 		 212 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  26.74 
 
 		 329 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  31.01 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  30.16 
 
 		 230 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  30.16 
 
 		 230 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  29.29 
 
 		 216 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  27.54 
 
 		 210 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  28.26 
 
 		 216 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  28.26 
 
 		 216 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  23.68 
 
 		 542 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 216 aa  50.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  26.04 
 
 		 269 aa  50.4  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  28.18 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  26.95 
 
 		 215 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  25 
 
 		 203 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  27.52 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  26.95 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 212 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  30.67 
 
 		 204 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  29.58 
 
 		 277 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  32.8 
 
 		 229 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  26.03 
 
 		 296 aa  47.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  27.27 
 
 		 224 aa  47  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  27.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  27.01 
 
 		 221 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  25.37 
 
 		 249 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>