16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2995 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2995  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  507  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.140186  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1712  hypothetical protein  63.22 
 
 
243 aa  329  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0676691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0312  hypothetical protein  60.91 
 
 
263 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0370302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2130  hypothetical protein  35.55 
 
 
263 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  30.31 
 
 
577 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  31.03 
 
 
574 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  31.75 
 
 
1046 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10791  hypothetical protein  32.55 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4950  hypothetical protein  31.35 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.33122  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4567  hypothetical protein  31.35 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4655  hypothetical protein  31.35 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1303  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0011  hypothetical protein  23.2 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0250  hypothetical protein  27.86 
 
 
391 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2838  hypothetical protein  27.8 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847655  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2118  hypothetical protein  21.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>