17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0312 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0312  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  547  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0370302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1712  hypothetical protein  61.73 
 
 
243 aa  317  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0676691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2995  hypothetical protein  60.91 
 
 
246 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.140186  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  33.74 
 
 
574 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  31.82 
 
 
577 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2130  hypothetical protein  35.2 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10791  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  30.8 
 
 
1046 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4567  hypothetical protein  31.6 
 
 
242 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4655  hypothetical protein  31.6 
 
 
242 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4950  hypothetical protein  31.6 
 
 
242 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.33122  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1303  hypothetical protein  29.96 
 
 
246 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0250  hypothetical protein  28.24 
 
 
391 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2838  hypothetical protein  26.32 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847655  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0011  hypothetical protein  24.02 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2118  hypothetical protein  22.76 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2284  hypothetical protein  20.69 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>