17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4655 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4567  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4950  hypothetical protein  99.59 
 
 
242 aa  483  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.33122  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4655  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10791  hypothetical protein  58.92 
 
 
259 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  53.94 
 
 
1046 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  53.82 
 
 
577 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  51.41 
 
 
574 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2130  hypothetical protein  36.55 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0312  hypothetical protein  31.6 
 
 
263 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0370302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2995  hypothetical protein  31.35 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.140186  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1712  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0676691  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0250  hypothetical protein  31.5 
 
 
391 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1303  hypothetical protein  29.67 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2838  hypothetical protein  27.8 
 
 
280 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847655  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2284  hypothetical protein  23.81 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2118  hypothetical protein  36.59 
 
 
281 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2014  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.920858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>