More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1250 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  47.89 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  52.22 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  45.95 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  45.41 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  45.41 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  44.22 
 
 		 201 aa  150  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  40.1 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  40.84 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  41.11 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  41.11 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  41.11 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  41.11 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  40 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  40.56 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  40.56 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.76 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  37.06 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  40.78 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.14 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.96 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  35.64 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  38.92 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.76 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.68 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.08 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  36.95 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  35.6 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  33.85 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.52 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.12 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  38.8 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  34.39 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  34.13 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.09 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  32.16 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  34.72 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  33.53 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  29.33 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  34.66 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.06 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  27.67 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  26.21 
 
 		 259 aa  92  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  37.57 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.44 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  27.96 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  28.19 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  34.3 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  37.7 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  24.45 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.54 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.93 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  34.09 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  28.65 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  38.1 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  27.66 
 
 		 225 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  27.14 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  29.46 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  24.77 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  37.14 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  30.2 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  26.17 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  33.13 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.06 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  24.23 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  30.91 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  29.03 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  27.32 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  30.8 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  30.48 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  29.7 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.34 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  27.32 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  26.34 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  29.9 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.09 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  28.25 
 
 		 819 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.77 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>