More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0138 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  539  1e-152  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
267 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
267 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
267 aa  243  2e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
268 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
262 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
266 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
268 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.13 
 
 
268 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  44.11 
 
 
267 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
268 aa  184  1e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
268 aa  184  1e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
268 aa  184  1e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522448  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
259 aa  179  6e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
268 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230051  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
256 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
259 aa  174  2e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
272 aa  174  2e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
264 aa  173  3e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79752e-08 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
255 aa  173  3e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
263 aa  172  4e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
264 aa  172  4e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
259 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  41.7 
 
 
259 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
263 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
260 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
261 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6045e-07 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.1 
 
 
256 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
261 aa  164  1e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
269 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
259 aa  162  5e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
262 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
258 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
258 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
259 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
264 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  37.4 
 
 
258 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
259 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
266 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.29698e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
267 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  41.47 
 
 
266 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
266 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
256 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
257 aa  155  5e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  155  5e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 
266 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
269 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
260 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
271 aa  153  3e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
294 aa  153  3e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
264 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
263 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
269 aa  152  6e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
259 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
266 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
258 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.15 
 
 
258 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
258 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
262 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
262 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
321 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
262 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.51 
 
 
263 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
262 aa  148  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
289 aa  147  2e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
262 aa  147  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.83 
 
 
258 aa  147  2e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.91 
 
 
296 aa  147  2e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
258 aa  146  4e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
267 aa  146  4e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  4.30049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
269 aa  145  7e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.88771e-05 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.28 
 
 
259 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
259 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
251 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
344 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
271 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  38.58 
 
 
264 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  32.28 
 
 
259 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
266 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
257 aa  141  1e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
255 aa  141  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
267 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
281 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
281 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
266 aa  140  2e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
266 aa  140  2e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
266 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
360 aa  139  4e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
257 aa  139  5e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
273 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
269 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.95 
 
 
265 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
265 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
258 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.03 
 
 
292 aa  138  8e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
276 aa  138  9e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>