49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0098 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  78.15 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  76.77 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  61.45 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  54.22 
 
 		 272 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  49.19 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  40.24 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  37.8 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  39.75 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  39.75 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  36.89 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  38.59 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 307 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  33.33 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.77 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  38.37 
 
 		 581 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  35.16 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  33.85 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  35.02 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 302 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  31.52 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  28.79 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  30.34 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  23.26 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  26.05 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>