More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0340 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 
251 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 
253 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 
252 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 
253 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
254 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
254 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
252 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
252 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 
252 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 
253 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 
247 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
266 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
266 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
248 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.18 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.8 
 
 
266 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.8 
 
 
266 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 
248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.74 
 
 
263 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
253 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  29.39 
 
 
502 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  29.39 
 
 
502 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.83 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
248 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.05 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.69 
 
 
493 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.28 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.28 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  29.58 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
284 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
257 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
281 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  24.68 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  24.56 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28 
 
 
265 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.23 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  24.39 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  24.39 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  24.39 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  24.39 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  24.39 
 
 
246 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  27.98 
 
 
263 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02234  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2687  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1343  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.908604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2541  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.75 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3449  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2459  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2465  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02194  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2495  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.75 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.89405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2603  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  25.39 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.11 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2704  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.31 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2583  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.31 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  25.48 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.11 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2595  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.31 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473996  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.11 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.68 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  28.22 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  28.77 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
265 aa  89  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.32 
 
 
270 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
264 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>