More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3570 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3570  PfkB  100 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  55.18 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  55.18 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  56.86 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  56.19 
 
 		 299 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.93 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  44.55 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.85 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  39.8 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.33 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.95 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.03 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.33 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.86 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.26 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  46.15 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  42.67 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.03 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.26 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.47 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.81 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.91 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.33 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  40.8 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  35.57 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.63 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.07 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.73 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  42.76 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  45.64 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.72 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  39.14 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.05 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.14 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.62 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.92 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  38.13 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.07 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  39.53 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.16 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.53 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.73 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.71 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  35.86 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.91 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  40.59 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.92 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.42 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  42.67 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.67 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.67 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.67 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.09 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.12 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  41.3 
 
 		 349 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.58 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  42.28 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  40.4 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  38.67 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  39.02 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.85 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.03 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.97 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.87 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.12 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  38.33 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.33 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  40.4 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.11 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  36.3 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.12 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  38 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  37.97 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.67 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  41.41 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.79 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.46 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.51 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.46 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.46 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  37.25 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.54 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.54 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  38.31 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.54 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  37.97 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.54 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  37.58 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  38.31 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  34.65 
 
 		 404 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  37.97 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  37.97 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.91 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>