More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2117 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
362 aa  730    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  67.42 
 
 
354 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  67.42 
 
 
354 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  66.28 
 
 
352 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  65.4 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  65.06 
 
 
367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  67.44 
 
 
352 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  53.6 
 
 
352 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  54.15 
 
 
351 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  53.8 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  52.48 
 
 
349 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  54.84 
 
 
344 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  54.84 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  53.08 
 
 
344 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  49.3 
 
 
348 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
357 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 
358 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  40 
 
 
364 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  38.89 
 
 
362 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.24 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
389 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
401 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
398 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.92 
 
 
382 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.48 
 
 
411 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
403 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.8 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
819 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  30.95 
 
 
408 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
379 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  32.95 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
381 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.55 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.55 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 
413 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.35 
 
 
406 aa  89.7  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
385 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
363 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
399 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
394 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
405 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
426 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
423 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
408 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  37.5 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
384 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  34.15 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.47 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.23 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  29.01 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.08 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.28 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>