More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3565 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
158 aa  316  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  62.33 
 
 
154 aa  190  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  66.18 
 
 
155 aa  186  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  61.02 
 
 
280 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  56.64 
 
 
202 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 
438 aa  117  8e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.36 
 
 
206 aa  114  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 
202 aa  111  4e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 
318 aa  111  4e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  56.9 
 
 
192 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  45.93 
 
 
442 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
211 aa  110  7e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.93 
 
 
226 aa  110  7e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  48.46 
 
 
207 aa  110  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  45.38 
 
 
362 aa  110  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  51.82 
 
 
244 aa  109  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.73 
 
 
291 aa  109  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  53.15 
 
 
203 aa  109  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  44.93 
 
 
216 aa  108  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 
242 aa  108  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
222 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 
199 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  54.03 
 
 
218 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  54.03 
 
 
197 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  53.64 
 
 
245 aa  108  4e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 
235 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  45.67 
 
 
362 aa  107  7e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  54.46 
 
 
218 aa  107  9e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 
208 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  53.57 
 
 
218 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
326 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  46.88 
 
 
188 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  52.73 
 
 
215 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.67 
 
 
239 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.14 
 
 
174 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 
197 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 
224 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  48.25 
 
 
196 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  46.96 
 
 
233 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 
198 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
194 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  49.07 
 
 
202 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  42.73 
 
 
191 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  48.18 
 
 
247 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 
199 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 
249 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 
243 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  54.29 
 
 
206 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
261 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  51.38 
 
 
325 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.15 
 
 
280 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  53.45 
 
 
208 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  44.53 
 
 
189 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.06 
 
 
368 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  48.18 
 
 
329 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  47.75 
 
 
204 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  50.85 
 
 
201 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
204 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 
212 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  54.29 
 
 
204 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 
189 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  48.28 
 
 
191 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 
239 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  46.85 
 
 
204 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  45.61 
 
 
218 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 
203 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 
299 aa  97.1  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  43.48 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
251 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
305 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
251 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 
217 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  50.48 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.91 
 
 
370 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.59 
 
 
273 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 
327 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
251 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45.37 
 
 
217 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 
215 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 
283 aa  95.5  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.35 
 
 
245 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 
263 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  47.29 
 
 
281 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3643  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
384 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0752757 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3817  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 
384 aa  94.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315131  normal  0.0342532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 
260 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3978  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
384 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
333 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  43.2 
 
 
354 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 
228 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  44.34 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 
296 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 
296 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  45.31 
 
 
280 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 
237 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>