More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2133 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
457 aa  916    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.56 
 
 
475 aa  678    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  68.55 
 
 
482 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  46.48 
 
 
472 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.69 
 
 
464 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.32 
 
 
459 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.5 
 
 
469 aa  361  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  43.2 
 
 
459 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.89 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.29 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.98 
 
 
459 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 
456 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.05 
 
 
459 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.95 
 
 
466 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 
464 aa  346  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.64 
 
 
459 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.97 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.97 
 
 
460 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.22 
 
 
461 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.97 
 
 
460 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.92 
 
 
460 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.45 
 
 
758 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  40.74 
 
 
461 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.68 
 
 
470 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.43 
 
 
459 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.9 
 
 
461 aa  329  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.73 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.38 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.38 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  41.8 
 
 
499 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.38 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.6 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.38 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.6 
 
 
470 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.38 
 
 
470 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.6 
 
 
470 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  41.89 
 
 
498 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.94 
 
 
470 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.9 
 
 
483 aa  322  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.43 
 
 
890 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.16 
 
 
470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.12 
 
 
460 aa  319  6e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.78 
 
 
460 aa  318  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.48 
 
 
482 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  41.57 
 
 
499 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  41.57 
 
 
499 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.3 
 
 
499 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.07 
 
 
459 aa  315  9e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.02 
 
 
494 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  38.7 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.27 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  39.48 
 
 
461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.92 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.31 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  40.75 
 
 
483 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.14 
 
 
459 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.92 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  37.77 
 
 
489 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  38.73 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.96 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.4 
 
 
503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40 
 
 
499 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.06 
 
 
887 aa  309  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  40.69 
 
 
499 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  38.95 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.6 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.87 
 
 
462 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.37 
 
 
493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  40.69 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 
503 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  37.14 
 
 
492 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  41.24 
 
 
499 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.64 
 
 
485 aa  306  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  38.96 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.88 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.17 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.17 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.4 
 
 
492 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.72 
 
 
486 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  40.88 
 
 
499 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.61 
 
 
501 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.69 
 
 
499 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
466 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  41.4 
 
 
467 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.47 
 
 
485 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.39 
 
 
499 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.32 
 
 
458 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  41.96 
 
 
461 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  39.83 
 
 
499 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  40.18 
 
 
499 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  40.18 
 
 
499 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 
499 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.75 
 
 
462 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.67 
 
 
457 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.18 
 
 
499 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  38.74 
 
 
462 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.56 
 
 
485 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 
461 aa  297  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  38.83 
 
 
499 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.60934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>