More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0895 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  100 
 
 
372 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  75.41 
 
 
372 aa  554  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  45.84 
 
 
378 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  41.24 
 
 
376 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  44.57 
 
 
375 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  38.01 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  44.65 
 
 
391 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  42.19 
 
 
367 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  42.63 
 
 
412 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  42.13 
 
 
381 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  44.59 
 
 
388 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  44.59 
 
 
388 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  45.3 
 
 
376 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  38.62 
 
 
408 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.16 
 
 
376 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  43.15 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  38.73 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  36.12 
 
 
391 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  42.48 
 
 
377 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  33.96 
 
 
374 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  34.23 
 
 
374 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  40.75 
 
 
385 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  40.73 
 
 
376 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  35.71 
 
 
385 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  35.25 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  34.79 
 
 
376 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  34.88 
 
 
376 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  33.97 
 
 
376 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  36.72 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  33.97 
 
 
376 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  34.67 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  34.32 
 
 
413 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  33.6 
 
 
413 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.74 
 
 
363 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.15 
 
 
394 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  31.35 
 
 
429 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  32.9 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  33.61 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  33.43 
 
 
383 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  35.77 
 
 
382 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  31.76 
 
 
407 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  39.32 
 
 
387 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  32.97 
 
 
383 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  34.31 
 
 
385 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  29.58 
 
 
410 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  31.54 
 
 
407 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  35.12 
 
 
382 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  35.12 
 
 
382 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  34.85 
 
 
382 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.56 
 
 
436 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.1 
 
 
409 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  30.71 
 
 
412 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  29.1 
 
 
432 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.95 
 
 
415 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.31 
 
 
436 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  33.06 
 
 
376 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.05 
 
 
436 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.55 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  29.26 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.13 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.55 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  33.16 
 
 
402 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  34.53 
 
 
423 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  32.17 
 
 
383 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  33.79 
 
 
389 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  33.54 
 
 
418 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.04 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  33.05 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.37 
 
 
405 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  28.31 
 
 
417 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  33.67 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  27.39 
 
 
424 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.83 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.07 
 
 
418 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.38 
 
 
422 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  34.19 
 
 
401 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  26.48 
 
 
424 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.29 
 
 
432 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  29.82 
 
 
441 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  30.16 
 
 
368 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25.24 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  25.32 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  30.26 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  28.22 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  24.16 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  31.55 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  26.38 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  29.38 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  25.4 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28.68 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  24.76 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.48 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  27.57 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.1 
 
 
368 aa  77  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  27.83 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  22.61 
 
 
743 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  25.81 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  25.88 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>