More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2209 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  59.9 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  54.46 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  52.24 
 
 		 234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  59.41 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  45.81 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  45.54 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.95 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  44.88 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  42.36 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  42.57 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  44.06 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  42.08 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  42.57 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  42 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  42 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  43.07 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  41.87 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  42.08 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  40.39 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.57 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  39.6 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  40.39 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  43.07 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  37.79 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  37.79 
 
 		 244 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  43.07 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  39.41 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  37.61 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 		 215 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  39.41 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  41.49 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  38.28 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  36.28 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  34.72 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 223 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  37.62 
 
 		 251 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  40.7 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 246 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  33.33 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  35.37 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  29.9 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.75 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  46 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.81 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 246 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  31.44 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.39 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  30.24 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  32.95 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  29.78 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  29.67 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  26.22 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  30.9 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  28.15 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  32.95 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>