More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1877 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 441 aa  901    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  74.15 
 
 		 440 aa  677    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  69.55 
 
 		 437 aa  634    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  73.86 
 
 		 443 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  70.18 
 
 		 446 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  58.77 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  58.2 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  58.77 
 
 		 444 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.14 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  51.81 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  51.96 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  51.96 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.43 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  48.71 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  47.2 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  47.96 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  46.85 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  46.96 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  46.96 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.29 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.06 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.43 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  38.17 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  40.79 
 
 		 442 aa  309  8e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  39.06 
 
 		 513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  40.24 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.1 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  40.71 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  41.52 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  40 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  40.52 
 
 		 542 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  37.77 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  37.93 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  37.5 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  38.62 
 
 		 436 aa  275  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  36.59 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.08 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  37.31 
 
 		 591 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  35.43 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  36.14 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.59 
 
 		 551 aa  266  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  36.53 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  36.2 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.94 
 
 		 512 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  35.19 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  36.71 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.04 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  35.27 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  36.77 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  36.07 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  36.26 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  36.94 
 
 		 451 aa  259  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  34.3 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  35.56 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  36.36 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35.29 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  36.16 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  36.83 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  37.07 
 
 		 435 aa  256  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  36.15 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  36.43 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.56 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  34.84 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  34.49 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  31.96 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  36.47 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  36.74 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  36.57 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.45 
 
 		 481 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.81 
 
 		 447 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  34.35 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.52 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  36.16 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  33.88 
 
 		 487 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  35.48 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  35.5 
 
 		 444 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  33.56 
 
 		 485 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  34.93 
 
 		 525 aa  249  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  35.25 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  33.64 
 
 		 487 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  36.36 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  34.34 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  34.34 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  35.71 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  34.16 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  36.24 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  35.2 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  34.34 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  34.34 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.22 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  34.99 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  37 
 
 		 452 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  37.29 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>