More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1731 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.46 
 
 		 69 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.46 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.91 
 
 		 68 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 		 68 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 68 aa  103  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.57 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 68 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 68 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  68.66 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  68.12 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 66 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  73.44 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  75.81 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2609  cold-shock protein, DNA-binding  65.22 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  74.19 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.12 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 70 aa  95.9  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.22 
 
 		 69 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  95.9  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  69.84 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  67.14 
 
 		 70 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 		 65 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  67.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  60.87 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  70 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  64.29 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  65.71 
 
 		 70 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  68.57 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0374  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  70 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  70 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  70 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  68.57 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  68.57 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  68.57 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  68.57 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  67.69 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  65.71 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>