More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1198 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  100 
 
 
204 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 
246 aa  177  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
238 aa  171  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  44.33 
 
 
234 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  44.83 
 
 
234 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
235 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
235 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 
235 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 
249 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
235 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
235 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
235 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  47.69 
 
 
235 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  46.15 
 
 
232 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  46.15 
 
 
232 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  45.64 
 
 
236 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 
236 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 
234 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.07 
 
 
237 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  40.1 
 
 
224 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  40.89 
 
 
236 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.01 
 
 
241 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
241 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  41 
 
 
231 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  50.28 
 
 
231 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 
258 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  49.72 
 
 
231 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  39 
 
 
379 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  41.29 
 
 
366 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 
365 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 
357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.22 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.54 
 
 
372 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  42.29 
 
 
356 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.1 
 
 
367 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.5 
 
 
359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  39.5 
 
 
359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 
364 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
329 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38 
 
 
365 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  40.5 
 
 
356 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 
359 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.42 
 
 
360 aa  137  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.79 
 
 
381 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 
361 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 
381 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
345 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  38.5 
 
 
343 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 
347 aa  136  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
343 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  40.3 
 
 
342 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 
395 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  37.69 
 
 
362 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
351 aa  136  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  38 
 
 
350 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  39.8 
 
 
329 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1181  ABC transporter related  41.48 
 
 
364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000170044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.31 
 
 
363 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 
380 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1159  ABC transporter related  41.48 
 
 
364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000201469  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  39.41 
 
 
341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.1 
 
 
363 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
381 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  40.3 
 
 
356 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  40.7 
 
 
347 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  37.81 
 
 
350 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.04 
 
 
357 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  42.5 
 
 
387 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  45.81 
 
 
231 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 
370 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  40 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  40.69 
 
 
527 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  39.7 
 
 
359 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.83 
 
 
352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2400  ABC transporter related  38.81 
 
 
358 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511263  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  40.39 
 
 
353 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.33 
 
 
358 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
369 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 
376 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  39.11 
 
 
359 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.11 
 
 
356 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.19 
 
 
348 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36 
 
 
373 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  34.34 
 
 
370 aa  132  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 
382 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  35.12 
 
 
352 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  38 
 
 
354 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>