93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00040 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  34.52 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  31.93 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  34.01 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  27.23 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  27.23 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  31.91 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  28.91 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  33.51 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  32.95 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  35.81 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.19 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  34.27 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.82 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  32.02 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  28.64 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  28.51 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  30.62 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  29.65 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  31.05 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  32.12 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  32.12 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  29.32 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  31.64 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  31.76 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  30.1 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  33.15 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  30.53 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  30.53 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  36.29 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  36.29 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  31.1 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  30.06 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  29.32 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  31.95 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  24.38 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  24.24 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 920 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  25.81 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  32.67 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.5 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  30.21 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  30.63 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  30.21 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  30.07 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  29.06 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  32.12 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  30.52 
 
 		 342 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  29.17 
 
 		 170 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  27.66 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  28.5 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  30.86 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  29.79 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  28.85 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  26.4 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  30.26 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  31.33 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  26.77 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  31.33 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  24.43 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  32.89 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  26.77 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  31.65 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  31.34 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  26.03 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  30.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  32.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  23.23 
 
 		 357 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  32.91 
 
 		 158 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>