More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6682 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  85.98 
 
 		 429 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  100 
 
 		 435 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  72.86 
 
 		 425 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  72.62 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  75.68 
 
 		 415 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  59.11 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  57.11 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  61.03 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  57.38 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  57.11 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  57.48 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  56.31 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  55.84 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  54.78 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  57.01 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  58.23 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  55.99 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  54.67 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  56.13 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  55.81 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  56.55 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  54.99 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  56.4 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  56.32 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  56.32 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  57.66 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  53.44 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  53.57 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  52.51 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  54.98 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  50.35 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  51.41 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 408 aa  282  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 426 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.15 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  45.05 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  46.65 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.12 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  44.56 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  40.32 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.3 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.08 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.92 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.53 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  37.05 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38.77 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.48 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  44.78 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  44.31 
 
 		 363 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.98 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.32 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  45.1 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  41.08 
 
 		 359 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  43.38 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  42.62 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.48 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.2 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.42 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  45.13 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  44.96 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.93 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  35.48 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  50.51 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.02 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.38 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.22 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 357 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  39.07 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 		 371 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  41.29 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 345 aa  224  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  42.31 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.21 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 357 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 390 aa  223  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  38.87 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.12 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  45.42 
 
 		 362 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  43.42 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.4 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.88 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  44.81 
 
 		 364 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  32.63 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  41.41 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.81 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  42.48 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  33.25 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>