253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1214 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  43.51 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  40.29 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  36.97 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  36.46 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  34.74 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  36.04 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  35.34 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  39.02 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.52 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.92 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  24.76 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  25.68 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  27.15 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  24.04 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  26.39 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  25.66 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  25.88 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>