More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1453 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  34.16 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.16 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.16 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.04 
 
 
246 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  34.46 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  33.04 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.44 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.86 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  28.51 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.51 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  27.52 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  23.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.38 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.22 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.86 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  28.32 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  23.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  23.21 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.26 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.75 
 
 
200 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  30.86 
 
 
197 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
291 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
274 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 
265 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  23.63 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.67 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
269 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  30.29 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  29.71 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  29.6 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  28.12 
 
 
208 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  23.9 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.76 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  25.22 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.02 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.29 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.09 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  33.91 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.4 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
362 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  24.79 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.17 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
189 aa  49.3  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.83 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.32 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  22.49 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  26.87 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0484  hypothetical protein  28.83 
 
 
138 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.873682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.7 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>