More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2396 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  88.48 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  88.94 
 
 		 217 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  76.04 
 
 		 221 aa  348  3e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  78.2 
 
 		 218 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  77.25 
 
 		 218 aa  338  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  75 
 
 		 219 aa  337  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  74.54 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  74.07 
 
 		 219 aa  334  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  71.43 
 
 		 217 aa  321  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  71.43 
 
 		 217 aa  321  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  70.97 
 
 		 217 aa  321  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  70.05 
 
 		 222 aa  319  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  69.59 
 
 		 226 aa  315  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  66.82 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  64.49 
 
 		 219 aa  291  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  65.09 
 
 		 221 aa  286  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  63.3 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  64.11 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  62.04 
 
 		 218 aa  278  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  61.06 
 
 		 229 aa  277  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  65.4 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  62.74 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  64.32 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  62.26 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  62.62 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  60.75 
 
 		 238 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  60.1 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  58.88 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  61.78 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  60.27 
 
 		 222 aa  267  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  60.27 
 
 		 222 aa  267  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.32 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 262 aa  266  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 278 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 395 aa  265  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 302 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 211 aa  262  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 210 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  60.55 
 
 		 221 aa  258  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 241 aa  257  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  55.83 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  254  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 226 aa  254  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 244 aa  254  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 228 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 292 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  57.69 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 228 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 227 aa  254  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  57.34 
 
 		 226 aa  254  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  53.62 
 
 		 341 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  55.14 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  54.55 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  53.74 
 
 		 274 aa  252  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  54.33 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  57 
 
 		 227 aa  250  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  57 
 
 		 227 aa  250  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>