More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1051 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  59.01 
 
 		 302 aa  345  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  56.18 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  51.14 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  49.13 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  48.79 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.24 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  51.12 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  49.44 
 
 		 308 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  49.81 
 
 		 308 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  51.66 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  50 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  49.63 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  49.44 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  50.18 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  50 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  50.75 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  51.49 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.63 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.36 
 
 		 337 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  47.08 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  49.63 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  49.64 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  47.64 
 
 		 313 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  49.24 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  47.64 
 
 		 313 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  47.64 
 
 		 313 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 340 aa  285  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  47.91 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  44.89 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  47.9 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.89 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  50 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  46.83 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  49.36 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  44.63 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  44.63 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  44.21 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  37.45 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.51 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  34.12 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  37.32 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  38.95 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  38.58 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.07 
 
 		 307 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.15 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  38.94 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  32.86 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  36.25 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  37.25 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.32 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  37.35 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  38.65 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  34.88 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.82 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.5 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.13 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.35 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  31.43 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  36.52 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  39.29 
 
 		 287 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  35.8 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  35.71 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 244 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  35.37 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  32.65 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  38.18 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.17 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  35.14 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>