255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  42.41 
 
 		 1067 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  42.34 
 
 		 985 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  39.37 
 
 		 965 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  44.03 
 
 		 1009 aa  778    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  38.88 
 
 		 1012 aa  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  38.01 
 
 		 984 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  41.37 
 
 		 1000 aa  773    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  37.67 
 
 		 1010 aa  635    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  100 
 
 		 1006 aa  2070    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  41.81 
 
 		 1027 aa  722    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1022 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  40.99 
 
 		 989 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  42.6 
 
 		 1029 aa  739    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  40.27 
 
 		 1008 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  45.06 
 
 		 1007 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  41.87 
 
 		 1035 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  39.72 
 
 		 1052 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  38.24 
 
 		 1009 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  37.45 
 
 		 1060 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  37.46 
 
 		 1069 aa  625  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  36.71 
 
 		 971 aa  621  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  39.79 
 
 		 1004 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1059 aa  619  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  37.52 
 
 		 997 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  39.63 
 
 		 1039 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  37.85 
 
 		 992 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1039 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  37.9 
 
 		 999 aa  591  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  35.95 
 
 		 1067 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1041 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  36.77 
 
 		 1063 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  38.87 
 
 		 1033 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  34.94 
 
 		 990 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  36.37 
 
 		 1087 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1031 aa  552  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  34.73 
 
 		 983 aa  550  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  35.64 
 
 		 1002 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  35.57 
 
 		 1102 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  34.03 
 
 		 991 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1081 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  35 
 
 		 1023 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  37.55 
 
 		 1051 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  38.91 
 
 		 976 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  40.58 
 
 		 905 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.49 
 
 		 1073 aa  525  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  34.68 
 
 		 1112 aa  522  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  34.48 
 
 		 1011 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  33.01 
 
 		 969 aa  498  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  33.62 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  33.49 
 
 		 1022 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  35.56 
 
 		 1016 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  35.68 
 
 		 1078 aa  485  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  33.58 
 
 		 1085 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  33.56 
 
 		 1079 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  33.33 
 
 		 1034 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  29.83 
 
 		 1035 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  31.64 
 
 		 1142 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.62 
 
 		 1046 aa  134  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.66 
 
 		 1084 aa  132  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  25.74 
 
 		 1051 aa  126  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.78 
 
 		 1044 aa  124  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.23 
 
 		 1042 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.98 
 
 		 986 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.5 
 
 		 1044 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  25.67 
 
 		 1210 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.6 
 
 		 1031 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.35 
 
 		 1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.72 
 
 		 1060 aa  118  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.82 
 
 		 1084 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.92 
 
 		 1032 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.74 
 
 		 1010 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 		 1289 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.54 
 
 		 1040 aa  115  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.4 
 
 		 1044 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.98 
 
 		 1045 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.36 
 
 		 1041 aa  114  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.82 
 
 		 1067 aa  112  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.73 
 
 		 1072 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.84 
 
 		 1022 aa  112  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.84 
 
 		 1022 aa  112  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.45 
 
 		 855 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.5 
 
 		 1034 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  26.45 
 
 		 1042 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.54 
 
 		 1029 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.12 
 
 		 1028 aa  108  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.7 
 
 		 1053 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.72 
 
 		 1068 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.39 
 
 		 1026 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.1 
 
 		 1024 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  24.66 
 
 		 1061 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3906  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.19 
 
 		 1097 aa  104  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0281  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.43 
 
 		 1028 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000241298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0037  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.31 
 
 		 1061 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0028  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.37 
 
 		 1046 aa  103  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.77996  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.39 
 
 		 1029 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.83 
 
 		 1070 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.54 
 
 		 1035 aa  102  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  25.51 
 
 		 1040 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.21 
 
 		 1092 aa  102  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.19 
 
 		 1023 aa  101  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>