238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1482 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  100 
 
 
1081 aa  2249    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  68.47 
 
 
1102 aa  1558    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  41.32 
 
 
1009 aa  693    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  36.37 
 
 
1035 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  40.47 
 
 
1027 aa  693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  52.49 
 
 
1063 aa  1113    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  38.34 
 
 
1008 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  40.33 
 
 
1000 aa  684    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  41.16 
 
 
1085 aa  770    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  41.69 
 
 
1078 aa  805    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  43.69 
 
 
1039 aa  799    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  41.12 
 
 
1041 aa  720    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 
905 aa  743    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  39.01 
 
 
1022 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  53.78 
 
 
1067 aa  1140    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  42.33 
 
 
1051 aa  751    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  65.98 
 
 
1112 aa  1516    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  39.34 
 
 
1029 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  56.62 
 
 
1087 aa  1222    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  40.02 
 
 
1079 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  57.34 
 
 
1052 aa  1209    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  52.88 
 
 
1060 aa  1107    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  53.16 
 
 
1069 aa  1118    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  45.28 
 
 
1039 aa  859    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  39.13 
 
 
1007 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  43.96 
 
 
1035 aa  846    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  40.7 
 
 
1073 aa  695    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  53.34 
 
 
1059 aa  1121    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  44.13 
 
 
1033 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.05 
 
 
985 aa  625  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  38.78 
 
 
984 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  35.97 
 
 
1012 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  36.01 
 
 
1009 aa  602  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.52 
 
 
1004 aa  601  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  37.3 
 
 
989 aa  595  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  35.16 
 
 
1010 aa  586  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  34.86 
 
 
1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  36.94 
 
 
992 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  36.08 
 
 
1142 aa  548  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  35.81 
 
 
991 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  37.74 
 
 
965 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  35.51 
 
 
971 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  35.79 
 
 
1006 aa  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  35.63 
 
 
997 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  35.76 
 
 
999 aa  512  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  36.02 
 
 
1011 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  35.89 
 
 
1016 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  34.93 
 
 
990 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  35.22 
 
 
983 aa  497  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  39.92 
 
 
976 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  32.9 
 
 
1002 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  34.37 
 
 
1022 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  33.6 
 
 
969 aa  474  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  32.79 
 
 
1034 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  34.37 
 
 
1023 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  33.15 
 
 
1031 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  33.24 
 
 
1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  38.94 
 
 
313 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  22.84 
 
 
1031 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  25.31 
 
 
1051 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.79 
 
 
1003 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.69 
 
 
1044 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.66 
 
 
1003 aa  110  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.22 
 
 
1060 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.99 
 
 
1084 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  24.15 
 
 
1042 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.99 
 
 
1030 aa  103  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  23.45 
 
 
1059 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.14 
 
 
986 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.6 
 
 
967 aa  102  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.6 
 
 
967 aa  102  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.23 
 
 
1074 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.53 
 
 
1060 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.36 
 
 
1079 aa  102  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.84 
 
 
1035 aa  101  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2256  type I restriction-modification system, R subunit  23.48 
 
 
1061 aa  101  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.81 
 
 
1084 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.96 
 
 
1044 aa  100  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.59 
 
 
1053 aa  99  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  25.46 
 
 
1060 aa  98.6  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.3 
 
 
1040 aa  98.2  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24 
 
 
1032 aa  97.8  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.39 
 
 
1070 aa  97.8  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  23.63 
 
 
1210 aa  96.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.4 
 
 
1042 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175068  normal  0.39911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24 
 
 
1032 aa  96.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.56 
 
 
1067 aa  97.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2674  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.93 
 
 
1027 aa  96.3  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  26.76 
 
 
1040 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0008  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.96 
 
 
1099 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4929  hypothetical protein  24.62 
 
 
1088 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.806169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.64 
 
 
1042 aa  93.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.61 
 
 
1034 aa  93.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.08 
 
 
1046 aa  93.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.8 
 
 
1024 aa  92  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.66 
 
 
1029 aa  91.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.68 
 
 
995 aa  91.3  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  24.02 
 
 
1033 aa  90.5  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  24.51 
 
 
1289 aa  90.9  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2363  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.96 
 
 
1067 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.267976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>